La Universidad Autónoma del Estado de Quintana Roo es responsable de organizar y conservar sus archivos; de la operación de su sistema institucional; del cumplimiento de lo dispuesto por la Ley General de Archivos; las correspondientes de las entidades federativas y las determinaciones que emita el Consejo Nacional o el Consejo Local, según corresponda; y deberán garantizar que no se sustraigan, dañen o eliminen documentos de archivo y la información a su cargo.
El Sistema Institucional de la Universidad está integrado por:
I. Responsable del área coordinadora de archivos: Mtro. Miguel Marcial Canul Dzul.
II. Las áreas operativas siguientes:
a) Oficial de partes: Mtro. Michell Díaz Tello
b) Responsables de archivo de trámite:
c) Responsable de archivo de concentración: Mtro. William Enrique Paredes Benabides.
d) Responsable de archivo histórico: Lic. Daniel Vargas Espinoza.